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依據環保署統計，八十三年十二月三十日環評法施行以來，經環評審查否決開發行為案件比率百分之六點四二，近七年否決比率更下降百分之二點一九。

環保署強調，我國環評審查雖具否決權，但實際運作上，仍是透過環評程序，建構開發行為環境資訊公開及權益相關者參與管道，以釐清科學推估極限上可以確定或無法確定之內容，必要時考量背景環境特性，要求採用更嚴格之約定值、最佳可行污染防制（治）技術、總量抵減或零排放等方式，以符合環境品質標準或使現已不符環境品質標準者不致繼續惡化，至於否決權僅屬環評審查最後考量之選項，倘若開發單位已確實回應各界質疑且對環境無重大影響，將不至於作成否決之審查結論。

環保署也說明，近來諸多環評制度研究報告（如前行政院研究發展考核委員會九十九年委託葉俊榮教授「環評制度問題探討」、法務部一○○年委託陳愛娥教授「行政程序法行政計畫章│以德國法制及實務之觀察為出發」、中技社一○○年「環評制度與實務」專案報告）論及「否決權制度衍生法院審查阻礙」、「環評審查非獨立行政處分」、「否決權具討論空間」等看法，環保署認為，「刪除否決權，回歸目的事業主管機關審查」雖與環評精神吻合，惟恐衍生社會重大爭議，尚須與社會各界充分溝通凝聚共識，討論出一個符合國內發展可長可久的環評制度後，再進行修法。